Abbracciato dalle montagne dell'Alaska, Kodiak è dotata di un piccolo aeroporto per il traffico civile e commerciale, moderno e funzionale, situato a circa 8 km a sud della città, con una pista di atterraggio e due destinate al decollo.
La struttura offre i servizi essenziali per la gestione ottimale delle operazioni di arrivo e partenza. È collegato con voli diretti con le maggiori città dello Stato come Anchorage, sede di un aeroporto internazionale, Fairbanks, Homer, Kenai, Deadhorsee Juneau.
Le principali compagnie aeree presenti nell’aeroporto di Kodiak sono l'Alaska Airlines, l'Era Alaska, la Servant Air e l'Island Air Service.